Finale: 20.08.2004
| Medaille | Sportler | Nation |
| Gold | Michael Phelps | USA |
| Silber | Ian Crocker | USA |
| Bronze | Andrej Serdinow | Ukraine |
| Rang | Sportler | Nation | Sekunden |
| 1 | Michael Phelps | USA | 51,25 |
| 2 | Ian Crocker | USA | 51,29 |
| 3 | Andrej Serdinow | Ukraine | 51,36 |
| 4 | Thomas Rupprath | Deutschland | 52,27 |
| 5 | Igor Martschenko | Russland | 52,32 |
| 6 | Gabriel Mangbeira | Brasilien | 52,34 |
| 7 | Duje Draganja | Kroatien | 52,46 |
| 8 | Geoffrey Huegill | Australien | 52,56 |